Up-regulation of GINS1 highlighted a good diagnostic and prognostic potential of survival in three different subtypes of human cancer

Abstract Cancer is a fatal malignancy and its increasing worldwide prevalence demands the discovery of more sensitive and reliable molecular biomarkers. To investigate the GINS1 expression level and its prognostic value in distinct human cancers using a series of multi-layered in silico approach may help to establish it as a potential shared diagnostic and prognostic biomarker of different cancer subtypes. The GINS1 mRNA, protein expression, and promoter methylation were analyzed using UALCAN and Human Protein Atlas (HPA), while mRNA expression was further validated via GENT2. The potential prognostic values of GINS1 were evaluated through KM plotter. Then, cBioPortal was utilized to examine the GINS1-related genetic mutations and copy number variations (CNVs), while pathway enrichment analysis was performed using DAVID. Moreover, a correlational analysis between GINS1 expression and CD8+ T immune cells and a the construction of gene-drug interaction network was performed using TIMER, CDT, and Cytoscape. The GINS1 was found down-regulated in a single subtypes of human cancer while commonly up-regulated in 23 different other subtypes. The up-regulation of GINS1 was significantly correlated with the poor overall survival (OS) of Liver Hepatocellular Carcinoma (LIHC), Lung Adenocarcinoma (LUAD), and Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC). The GINS1 was also found up-regulated in LIHC, LUAD, and KIRC patients of different clinicopathological features. Pathways enrichment analysis revealed the involvement of GINS1 in two diverse pathways, while few interesting correlations were also documented between GINS1 expression and its promoter methylation level, CD8+ T immune cells level, and CNVs. Moreover, we also predicted few drugs that could be used in the treatment of LIHC, LUAD, and KIRC by regulating the GINS1 expression. The expression profiling of GINS1 in the current study has suggested it a novel shared diagnostic and prognostic biomarker of LIHC, LUAD, and KIRC.

Resumo O câncer é uma doença maligna fatal e sua crescente prevalência mundial exige a descoberta de biomarcadores moleculares mais sensíveis e confiáveis. Investigar o nível de expressão de GINS1 e seu valor prognóstico em cânceres humanos distintos, usando uma série de abordagens in silico em várias camadas, pode ajudar a estabelecê-lo como um potencial biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de diferentes subtipos de câncer. O mRNA de GINS1, a expressão da proteína e a metilação do promotor foram analisados usando UALCAN e Human Protein Atlas (HPA), enquanto a expressão de mRNA foi posteriormente validada via GENT2. Os valores prognósticos potenciais de GINS1 foram avaliados por meio do plotter KM. Em seguida, o cBioPortal foi utilizado para examinar as mutações genéticas relacionadas ao GINS1 e as variações do número de cópias (CNVs), enquanto a análise de enriquecimento da via foi realizada usando DAVID. Além disso, uma análise correlacional entre a expressão de GINS1 e células imunes T CD8 + e a construção de uma rede de interação gene-droga foi realizada usando TIMER, CDT e Cytoscape. O GINS1 foi encontrado regulado negativamente em um único subtipo de câncer humano, enquanto comumente regulado positivamente em 23 outros subtipos diferentes. A regulação positiva de GINS1 foi significativamente correlacionada com a sobrevida global pobre (OS) de Carcinoma Hepatocelular de Fígado (LIHC), Adenocarcinoma de Pulmão (LUAD) e Carcinoma de Células Claras Renais de Rim (KIRC). O GINS1 também foi encontrado regulado positivamente em pacientes LIHC, LUAD e KIRC de diferentes características clínico-patológicas. A análise de enriquecimento de vias revelou o envolvimento de GINS1 em duas vias diversas, enquanto poucas correlações interessantes também foram documentadas entre a expressão de GINS1 e seu nível de metilação do promotor, nível de células imunes T CD8 + e CNVs. Além disso, também previmos poucos medicamentos que poderiam ser usados no tratamento de LIHC, LUAD e KIRC, regulando a expressão de GINS1. O perfil de expressão de GINS1 no estudo atual sugeriu que é um novo biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de LIHC, LUAD e KIRC.

Up-regulation of GINS1 highlighted a good diagnostic and prognostic potential of survival in three different subtypes of human cancer / A regulação positiva de GINS1 destacou um bom potencial diagnóstico e prognóstico de sobrevivência em três subtipos diferentes de câncer humano

Abstract Cancer is a fatal malignancy and its increasing worldwide prevalence demands the discovery of more sensitive and reliable molecular biomarkers. To investigate the GINS1 expression level and its prognostic value in distinct human cancers using a series of multi-layered in silico approach may help to establish it as a potential shared diagnostic and prognostic biomarker of different cancer subtypes. The GINS1 mRNA, protein expression, and promoter methylation were analyzed using UALCAN and Human Protein Atlas (HPA), while mRNA expression was further validated via GENT2. The potential prognostic values of GINS1 were evaluated through KM plotter. Then, cBioPortal was utilized to examine the GINS1-related genetic mutations and copy number variations (CNVs), while pathway enrichment analysis was performed using DAVID. Moreover, a correlational analysis between GINS1 expression and CD8+ T immune cells and a the construction of gene-drug interaction network was performed using TIMER, CDT, and Cytoscape. The GINS1 was found down-regulated in a single subtypes of human cancer while commonly up-regulated in 23 different other subtypes. The up-regulation of GINS1 was significantly correlated with the poor overall survival (OS) of Liver Hepatocellular Carcinoma (LIHC), Lung Adenocarcinoma (LUAD), and Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC). The GINS1 was also found up-regulated in LIHC, LUAD, and KIRC patients of different clinicopathological features. Pathways enrichment analysis revealed the involvement of GINS1 in two diverse pathways, while few interesting correlations were also documented between GINS1 expression and its promoter methylation level, CD8+ T immune cells level, and CNVs. Moreover, we also predicted few drugs that could be used in the treatment of LIHC, LUAD, and KIRC by regulating the GINS1 expression. The expression profiling of GINS1 in the current study has suggested it a novel shared diagnostic and prognostic biomarker of LIHC, LUAD, and KIRC.

Resumo O câncer é uma doença maligna fatal e sua crescente prevalência mundial exige a descoberta de biomarcadores moleculares mais sensíveis e confiáveis. Investigar o nível de expressão de GINS1 e seu valor prognóstico em cânceres humanos distintos, usando uma série de abordagens in silico em várias camadas, pode ajudar a estabelecê-lo como um potencial biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de diferentes subtipos de câncer. O mRNA de GINS1, a expressão da proteína e a metilação do promotor foram analisados ​​usando UALCAN e Human Protein Atlas (HPA), enquanto a expressão de mRNA foi posteriormente validada via GENT2. Os valores prognósticos potenciais de GINS1 foram avaliados por meio do plotter KM. Em seguida, o cBioPortal foi utilizado para examinar as mutações genéticas relacionadas ao GINS1 e as variações do número de cópias (CNVs), enquanto a análise de enriquecimento da via foi realizada usando DAVID. Além disso, uma análise correlacional entre a expressão de GINS1 e células imunes T CD8 + e a construção de uma rede de interação gene-droga foi realizada usando TIMER, CDT e Cytoscape. O GINS1 foi encontrado regulado negativamente em um único subtipo de câncer humano, enquanto comumente regulado positivamente em 23 outros subtipos diferentes. A regulação positiva de GINS1 foi significativamente correlacionada com a sobrevida global pobre (OS) de Carcinoma Hepatocelular de Fígado (LIHC), Adenocarcinoma de Pulmão (LUAD) e Carcinoma de Células Claras Renais de Rim (KIRC). O GINS1 também foi encontrado regulado positivamente em pacientes LIHC, LUAD e KIRC de diferentes características clínico-patológicas. A análise de enriquecimento de vias revelou o envolvimento de GINS1 em duas vias diversas, enquanto poucas correlações interessantes também foram documentadas entre a expressão de GINS1 e seu nível de metilação do promotor, nível de células imunes T CD8 + e CNVs. Além disso, também previmos poucos medicamentos que poderiam ser usados ​​no tratamento de LIHC, LUAD e KIRC, regulando a expressão de GINS1. O perfil de expressão de GINS1 no estudo atual sugeriu que é um novo biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de LIHC, LUAD e KIRC.

Genomic characterization of Puccinia triticina using molecular marker technology / Caracterização genômica de Puccinia triticina usando tecnologia de marcadores moleculares

Leaf rust, caused by Puccinia triticina, is the most common rust disease of wheat. The fungus is an obligate parasite capable of producing infectious urediniospores. To study the genetic structure of the leaf rust population 20 RAPD primers were evaluated on 15 isolates samples collected in Pakistan. A total of 105 RAPD fragments were amplified with an average of 7 fragments per primer. The number of amplified fragments varied from 1 to 12. GL Decamer L-07 and GL Decamer L-01 amplified the highest number of bands (twelve) and primer GL Decamer A-03 amplified the lowest number of bands i.e one. Results showed that almost all investigated isolates were genetically different that confirms high genetic diversity within the leaf rust population. Rust spores can follow the migration pattern in short and long distances to neighbor areas. Results indicated that the greatest variability was revealed by 74.9% of genetic differentiation within leaf rust populations. These results suggested that each population was not completely identical and high gene flow has occurred among the leaf rust population of different areas. The highest differentiation and genetic distance among the Pakistani leaf rust populations were detected between the leaf rust population in NARC isolate (NARC-4) and AARI-11and the highest similarity was observed between NARC isolates (NARC-4) and (NARC-5). The present study showed the leaf rust population in Pakistan is highly dynamic and variable.

A ferrugem da folha, causada por Puccinia triticina, é a ferrugem mais comum do trigo. O fungo é um parasita obrigatório, capaz de produzir urediniósporos infecciosos. Para estudar a estrutura genética da população de ferrugem da folha, 20 primers RAPD foram avaliados em 15 amostras de isolados coletadas no Paquistão. Um total de 105 fragmentos RAPD foram amplificados com uma média de 7 fragmentos por primer. O número de fragmentos amplificados variou de 1 a 12. GL Decamer L-07 e GL Decamer L-01 amplificaram o maior número de bandas (doze), e o primer GL Decamer A-03 amplificou o menor número de bandas, ou seja, um. Os resultados mostraram que quase todos os isolados investigados eram geneticamente diferentes, o que confirma a alta diversidade genética na população de ferrugem da folha. Os esporos de ferrugem podem seguir o padrão de migração em distâncias curtas e longas para áreas vizinhas. Os resultados indicaram que a maior variabilidade foi revelada por 74,9% da diferenciação genética nas populações de ferrugem. Esses resultados sugeriram que cada população não era completamente idêntica e um alto fluxo gênico ocorreu entre a população de ferrugem da folha de diferentes áreas. A maior diferenciação e distância genética entre as populações de ferrugem da folha do Paquistão foram detectadas entre a população de ferrugem da folha no isolado NARC (NARC-4) e AARI-11 e a maior similaridade foi observada entre os isolados NARC (NARC-4) e (NARC-5). O presente estudo mostrou que a população de ferrugem da folha no Paquistão é altamente dinâmica e variável.

Population distribution and habitat analysis of Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) in Abbottabad, Pakistan / Distribuição da população e análise de habitat de Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) em Abbottabad, Paquistão

The Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) belongs to family corvidae, order Passeriformes which includes about 100 species. The current study was conducted to gather information about the Population distribution and habitat analysis of D. vagabunda at District Abbottabad, Pakistan. The data were collected on monthly basis both morning and evening times (2018-2019). The "Point count Method" was used for population estimation and "Quadrates Method" for habitat analysis of study area. The result shows an average month-wise population density of D. vagabunda was maximum at Jhangra 0.14±0.039/ha, whereas minimum at Havelian 0.11±0.022/ha. There was no significant difference (p>0.05) among monthly population densities of D. vagabunda, however, a significant difference (p<0.05) was found between morning and evening times population of the specie. The present study revealed that importance value index (IVI) of plants species at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 59.6±12.6, 50.1±6.9, 53.4±6.3, 66.8±10 and 60.1±7.7. Likewise, the frequency of shrubs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 33.3±4.2, 45±9.4, 46.7±8.2, 55.6±22.2 and 37.5±8.5. Similarly, the frequency of herbs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 40.4±6.0, 37.5±5.6, 53.3±7.4, 48.5±5.2 and 46.9±7.4 respectively. Our results show the study area as suitable habitat for D. vagabunda.

A trepadeira Rufous (Dendrocitta vagabunda) pertence à família corvidae, ordem Passeriformes que inclui cerca de 100 espécies. O estudo atual foi realizado para reunir informações sobre a distribuição da população e análise do habitat de D. vagabunda no distrito de Abbottabad, Paquistão. Os dados foram coletados mensalmente pela manhã e à noite (2018-2019). O "método de contagem de pontos" foi usado para estimativa da população e o "método dos quadrados" para análise de habitat da área de estudo. O resultado mostra que uma densidade populacional média mensal de D. vagabunda foi máxima em Jhangra 0,14 ± 0,039 / ha, enquanto a mínima em Havelian 0,11 ± 0,022/ha. Não houve diferença significativa (p> 0,05) entre as densidades populacionais mensais de D. vagabunda, entretanto foi encontrada diferença significativa (p <0,05) entre os períodos matutino e noturno da população da espécie. O presente estudo revelou que o índice de valor de importância (IVI) das espécies de plantas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 59,6 ± 12,6, 50,1 ± 6,9, 53,4 ± 6,3, 66,8 ± 10 e 60,1 ± 7,7. Da mesma forma, a frequência de arbustos em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 33,3 ± 4,2, 45 ± 9,4, 46,7 ± 8,2, 55,6 ± 22,2 e 37,5 ± 8,5. Da mesma forma, a frequência de ervas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi: 40,4 ± 6,0, 37,5 ± 5,6, 53,3 ± 7,4, 48,5 ± 5,2 e 46,9 ± 7,4, respectivamente. Nossos resultados mostram a área de estudo como habitat adequado para D. vagabunda.

Antioxidant potential and alfa-glucosidase inhibitory activity of onion (Allium cepa L. ) peel and bulb extracts / Atividade antioxidante e potencial inibidor de alfa-glucosidase de extratos de casca e bulbo de cebola (Allium cepa) preparados por etanol e água

Allium cepa L. is a commonly consumed vegetable that belongs to the Amaryllidaceae family and contains nutrients and antioxidants in ample amounts. In spite of the valuable food applications of onion bulb, its peel and outer fleshy layers are generally regarded as waste and exploration of their nutritional and therapeutic potential is still in progress with a very slow progression rate. The present study was designed with the purpose of doing a comparative analysis of the antioxidant potential of two parts of Allium cepa, i.g., bulb (edible part) and outer fleshy layers and dry peels (inedible part). Moreover, the inhibitory effect of the onion bulb and peel extracts on rat intestinal α-glucosidase and pancreatic α-amylase of porcine was also evaluated. The antioxidant potential of onion peel and bulb extracts were evaluated using 2,2-diphenyl- 1-picryl hydrazyl (DPPH), ferric-reducing antioxidant power assay (FRAP), 2,2’-azino-bis- 3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid (ABTS) radical scavenging assay, H2O2 radical scavenging activity and Fe2+ chelating activity. Total flavonoids and phenolic content of ethanolic extract of onion peel were significantly greater as compared to that of onion bulb. Ethanolic extract of onion peel also presented better antioxidant and free-radical scavenging activity as compared to the ethanolic extract of bulb, while the aqueous extract of bulb presented weakest antioxidative potential. Onion peel extract's α-glucosidase inhibition potential was also correlated with their phenolic and flavonoid contents. The current findings presented onion peel as a possible source of antioxidative agents and phenolic compounds that might be beneficial against development of various common chronic diseases that might have an association with oxidative stress. Besides, outer dry layers and fleshy peels of onion exhibited higher phenolic content and antioxidant activities, compared [...].

Allium cepa pertence à família Liliaceae e é rica em nutrientes e antioxidantes. Apesar das expressivas aplicações alimentares do bulbo da cebola, sua casca e outras camadas externas são geralmente consideradas resíduos, e seu potencial nutricional e terapêutico ainda é pouco explorado. O presente estudo foi delineado com o objetivo de investigar comparativamente o potencial antioxidante de duas partes de Allium cepa, por exemplo o bulbo (parte comestível) e camadas externas e cascas secas (parte não comestível). Além disso, o efeito inibitório dos extratos do bulbo de cebola e casca sobre a α-glucosidase intestinal de ratos e α-amilase pancreática suína também foi avaliado. O potencial antioxidante dos extratos da casca de cebola e bulbo foi avaliado utilizando-se 2,2-difenil-1-picrilhidrazil (DPPH), método de poder antioxidante de redução do ferro (FRAP), método 2,2’-azino-bis-3-etilbenzotiazolina-6-ácido sulfônico (ABTS) de eliminação de radicais, atividade de eliminação de radicais H2O2 e atividade quelante do Fe2+. Os flavonoides totais e os teores fenólicos do extrato de etanol da casca de cebola foram significativamente maiores quando comparados ao do bulbo. O extrato de etanol da casca de cebola também apresentou melhor atividade antioxidante e eliminação de radicais livres quando comparado ao extrato de etanol do bulbo, enquanto o extrato aquoso de bulbo apresentou menor potencial antioxidante. O potencial de inibição da α-glicosidase dos extratos de casca de cebola correlacionou-se com seus teores fenólicos e de flavonoides. Os resultados encontrados identificaram que a casca de cebola é uma possível fonte de agentes antioxidantes e compostos fenólicos que podem ser benéficos contra o desenvolvimento de várias doenças crônicas que estão associadas ao estresse oxidativo. Além disso, as camadas externas secas e as cascas da cebola exibiram maior conteúdo fenólico e atividades [...].

Population distribution and habitat analysis of Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) in Abbottabad, Pakistan

Abstract The Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) belongs to family corvidae, order Passeriformes which includes about 100 species. The current study was conducted to gather information about the Population distribution and habitat analysis of D. vagabunda at District Abbottabad, Pakistan. The data were collected on monthly basis both morning and evening times (2018-2019). The Point count Method was used for population estimation and Quadrates Method for habitat analysis of study area. The result shows an average month-wise population density of D. vagabunda was maximum at Jhangra 0.14±0.039/ha, whereas minimum at Havelian 0.11±0.022/ha. There was no significant difference (p>0.05) among monthly population densities of D. vagabunda, however, a significant difference (p 0.05) was found between morning and evening times population of the specie. The present study revealed that importance value index (IVI) of plants species at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 59.6±12.6, 50.1±6.9, 53.4±6.3, 66.8±10 and 60.1±7.7. Likewise, the frequency of shrubs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 33.3±4.2, 45±9.4, 46.7±8.2, 55.6±22.2 and 37.5±8.5. Similarly, the frequency of herbs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 40.4±6.0, 37.5±5.6, 53.3±7.4, 48.5±5.2 and 46.9±7.4 respectively. Our results show the study area as suitable habitat for D. vagabunda.

Resumo A trepadeira Rufous (Dendrocitta vagabunda) pertence à família corvidae, ordem Passeriformes que inclui cerca de 100 espécies. O estudo atual foi realizado para reunir informações sobre a distribuição da população e análise do habitat de D. vagabunda no distrito de Abbottabad, Paquistão. Os dados foram coletados mensalmente pela manhã e à noite (2018-2019). O método de contagem de pontos foi usado para estimativa da população e o método dos quadrados para análise de habitat da área de estudo. O resultado mostra que uma densidade populacional média mensal de D. vagabunda foi máxima em Jhangra 0,14 ± 0,039 / ha, enquanto a mínima em Havelian 0,11 ± 0,022/ha. Não houve diferença significativa (p> 0,05) entre as densidades populacionais mensais de D. vagabunda, entretanto foi encontrada diferença significativa (p 0,05) entre os períodos matutino e noturno da população da espécie. O presente estudo revelou que o índice de valor de importância (IVI) das espécies de plantas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 59,6 ± 12,6, 50,1 ± 6,9, 53,4 ± 6,3, 66,8 ± 10 e 60,1 ± 7,7. Da mesma forma, a frequência de arbustos em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 33,3 ± 4,2, 45 ± 9,4, 46,7 ± 8,2, 55,6 ± 22,2 e 37,5 ± 8,5. Da mesma forma, a frequência de ervas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi: 40,4 ± 6,0, 37,5 ± 5,6, 53,3 ± 7,4, 48,5 ± 5,2 e 46,9 ± 7,4, respectivamente. Nossos resultados mostram a área de estudo como habitat adequado para D. vagabunda.

Antioxidant potential and -glucosidase inhibitory activity of onion (Allium cepa L.) peel and bulb extracts

Abstract Allium cepa L. is a commonly consumed vegetable that belongs to the Amaryllidaceae family and contains nutrients and antioxidants in ample amounts. In spite of the valuable food applications of onion bulb, its peel and outer fleshy layers are generally regarded as waste and exploration of their nutritional and therapeutic potential is still in progress with a very slow progression rate. The present study was designed with the purpose of doing a comparative analysis of the antioxidant potential of two parts of Allium cepa, i.g., bulb (edible part) and outer fleshy layers and dry peels (inedible part). Moreover, the inhibitory effect of the onion bulb and peel extracts on rat intestinal -glucosidase and pancreatic -amylase of porcine was also evaluated. The antioxidant potential of onion peel and bulb extracts were evaluated using 2,2-diphenyl- 1-picryl hydrazyl (DPPH), ferric-reducing antioxidant power assay (FRAP), 2,2-azino-bis- 3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid (ABTS) radical scavenging assay, H2O2 radical scavenging activity and Fe2+ chelating activity. Total flavonoids and phenolic content of ethanolic extract of onion peel were significantly greater as compared to that of onion bulb. Ethanolic extract of onion peel also presented better antioxidant and free-radical scavenging activity as compared to the ethanolic extract of bulb, while the aqueous extract of bulb presented weakest antioxidative potential. Onion peel extracts -glucosidase inhibition potential was also correlated with their phenolic and flavonoid contents. The current findings presented onion peel as a possible source of antioxidative agents and phenolic compounds that might be beneficial against development of various common chronic diseases that might have an association with oxidative stress. Besides, outer dry layers and fleshy peels of onion exhibited higher phenolic content and antioxidant activities, compared to the inner bulb. The information obtained by the present study can be useful in promoting the use of vegetable parts other than the edible mesocarp for several future food applications, rather than these being wasted.

Resumo Allium cepa pertence à família Liliaceae e é rica em nutrientes e antioxidantes. Apesar das expressivas aplicações alimentares do bulbo da cebola, sua casca e outras camadas externas são geralmente consideradas resíduos, e seu potencial nutricional e terapêutico ainda é pouco explorado. O presente estudo foi delineado com o objetivo de investigar comparativamente o potencial antioxidante de duas partes de Allium cepa, por exemplo o bulbo (parte comestível) e camadas externas e cascas secas (parte não comestível). Além disso, o efeito inibitório dos extratos do bulbo de cebola e casca sobre a -glucosidase intestinal de ratos e -amilase pancreática suína também foi avaliado. O potencial antioxidante dos extratos da casca de cebola e bulbo foi avaliado utilizando-se 2,2-difenil-1-picrilhidrazil (DPPH), método de poder antioxidante de redução do ferro (FRAP), método 2,2'-azino-bis-3-etilbenzotiazolina-6-ácido sulfônico (ABTS) de eliminação de radicais, atividade de eliminação de radicais H2O2 e atividade quelante do Fe2+. Os flavonoides totais e os teores fenólicos do extrato de etanol da casca de cebola foram significativamente maiores quando comparados ao do bulbo. O extrato de etanol da casca de cebola também apresentou melhor atividade antioxidante e eliminação de radicais livres quando comparado ao extrato de etanol do bulbo, enquanto o extrato aquoso de bulbo apresentou menor potencial antioxidante. O potencial de inibição da -glicosidase dos extratos de casca de cebola correlacionou-se com seus teores fenólicos e de flavonoides. Os resultados encontrados identificaram que a casca de cebola é uma possível fonte de agentes antioxidantes e compostos fenólicos que podem ser benéficos contra o desenvolvimento de várias doenças crônicas que estão associadas ao estresse oxidativo. Além disso, as camadas externas secas e as cascas da cebola exibiram maior conteúdo fenólico e atividades antioxidantes, em comparação com o bulbo interno. As informações obtidas pelo presente estudo podem promover o uso de outras partes vegetais além do mesocarpo comestível para futuras aplicações em alimentos, ao invés de serem desperdiçadas.

Antioxidant potential and α-glucosidase inhibitory activity of onion (Allium cepa L. ) peel and bulb extracts / Atividade antioxidante e potencial inibidor de glucosidase de extratos de casca e bulbo de cebola (Allium cepa) preparados por etanol e água

Abstract Allium cepa L. is a commonly consumed vegetable that belongs to the Amaryllidaceae family and contains nutrients and antioxidants in ample amounts. In spite of the valuable food applications of onion bulb, its peel and outer fleshy layers are generally regarded as waste and exploration of their nutritional and therapeutic potential is still in progress with a very slow progression rate. The present study was designed with the purpose of doing a comparative analysis of the antioxidant potential of two parts of Allium cepa, i.g., bulb (edible part) and outer fleshy layers and dry peels (inedible part). Moreover, the inhibitory effect of the onion bulb and peel extracts on rat intestinal α-glucosidase and pancreatic α-amylase of porcine was also evaluated. The antioxidant potential of onion peel and bulb extracts were evaluated using 2,2-diphenyl- 1-picryl hydrazyl (DPPH), ferric-reducing antioxidant power assay (FRAP), 2,2'-azino-bis- 3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid (ABTS) radical scavenging assay, H2O2 radical scavenging activity and Fe2+ chelating activity. Total flavonoids and phenolic content of ethanolic extract of onion peel were significantly greater as compared to that of onion bulb. Ethanolic extract of onion peel also presented better antioxidant and free-radical scavenging activity as compared to the ethanolic extract of bulb, while the aqueous extract of bulb presented weakest antioxidative potential. Onion peel extract's α-glucosidase inhibition potential was also correlated with their phenolic and flavonoid contents. The current findings presented onion peel as a possible source of antioxidative agents and phenolic compounds that might be beneficial against development of various common chronic diseases that might have an association with oxidative stress. Besides, outer dry layers and fleshy peels of onion exhibited higher phenolic content and antioxidant activities, compared to the inner bulb. The information obtained by the present study can be useful in promoting the use of vegetable parts other than the edible mesocarp for several future food applications, rather than these being wasted.

Resumo Allium cepa pertence à família Liliaceae e é rica em nutrientes e antioxidantes. Apesar das expressivas aplicações alimentares do bulbo da cebola, sua casca e outras camadas externas são geralmente consideradas resíduos, e seu potencial nutricional e terapêutico ainda é pouco explorado. O presente estudo foi delineado com o objetivo de investigar comparativamente o potencial antioxidante de duas partes de Allium cepa, por exemplo o bulbo (parte comestível) e camadas externas e cascas secas (parte não comestível). Além disso, o efeito inibitório dos extratos do bulbo de cebola e casca sobre a α-glucosidase intestinal de ratos e α-amilase pancreática suína também foi avaliado. O potencial antioxidante dos extratos da casca de cebola e bulbo foi avaliado utilizando-se 2,2-difenil-1-picrilhidrazil (DPPH), método de poder antioxidante de redução do ferro (FRAP), método 2,2'-azino-bis-3-etilbenzotiazolina-6-ácido sulfônico (ABTS) de eliminação de radicais, atividade de eliminação de radicais H2O2 e atividade quelante do Fe2+. Os flavonoides totais e os teores fenólicos do extrato de etanol da casca de cebola foram significativamente maiores quando comparados ao do bulbo. O extrato de etanol da casca de cebola também apresentou melhor atividade antioxidante e eliminação de radicais livres quando comparado ao extrato de etanol do bulbo, enquanto o extrato aquoso de bulbo apresentou menor potencial antioxidante. O potencial de inibição da α-glicosidase dos extratos de casca de cebola correlacionou-se com seus teores fenólicos e de flavonoides. Os resultados encontrados identificaram que a casca de cebola é uma possível fonte de agentes antioxidantes e compostos fenólicos que podem ser benéficos contra o desenvolvimento de várias doenças crônicas que estão associadas ao estresse oxidativo. Além disso, as camadas externas secas e as cascas da cebola exibiram maior conteúdo fenólico e atividades antioxidantes, em comparação com o bulbo interno. As informações obtidas pelo presente estudo podem promover o uso de outras partes vegetais além do mesocarpo comestível para futuras aplicações em alimentos, ao invés de serem desperdiçadas.

Population distribution and habitat analysis of Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) in Abbottabad, Pakistan / Distribuição da população e análise de habitat de Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) em Abbottabad, Paquistão

Abstract The Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) belongs to family corvidae, order Passeriformes which includes about 100 species. The current study was conducted to gather information about the Population distribution and habitat analysis of D. vagabunda at District Abbottabad, Pakistan. The data were collected on monthly basis both morning and evening times (2018-2019). "The ''Point count Method" was used for population estimation and ''Quadrates Method" for habitat analysis of study area. The result shows an average month-wise population density of D. vagabunda was maximum at Jhangra 0.14±0.039/ha, whereas minimum at Havelian 0.11±0.022/ha. There was no significant difference (p>0.05) among monthly population densities of D. vagabunda, however, a significant difference (p<0.05) was found between morning and evening times population of the specie. The present study revealed that importance value index (IVI) of plants species at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 59.6±12.6, 50.1±6.9, 53.4±6.3, 66.8±10 and 60.1±7.7. Likewise, the frequency of shrubs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 33.3±4.2, 45±9.4, 46.7±8.2, 55.6±22.2 and 37.5±8.5. Similarly, the frequency of herbs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 40.4±6.0, 37.5±5.6, 53.3±7.4, 48.5±5.2 and 46.9±7.4 respectively. Our results show the study area as suitable habitat for D. vagabunda.

Resumo A trepadeira Rufous (Dendrocitta vagabunda) pertence à família corvidae, ordem Passeriformes que inclui cerca de 100 espécies. O estudo atual foi realizado para reunir informações sobre a distribuição da população e análise do habitat de D. vagabunda no distrito de Abbottabad, Paquistão. Os dados foram coletados mensalmente pela manhã e à noite (2018-2019). O "método de contagem de pontos" foi usado para estimativa da população e o "método dos quadrados" para análise de habitat da área de estudo. O resultado mostra que uma densidade populacional média mensal de D. vagabunda foi máxima em Jhangra 0,14 ± 0,039 / ha, enquanto a mínima em Havelian 0,11 ± 0,022/ha. Não houve diferença significativa (p> 0,05) entre as densidades populacionais mensais de D. vagabunda, entretanto foi encontrada diferença significativa (p <0,05) entre os períodos matutino e noturno da população da espécie. O presente estudo revelou que o índice de valor de importância (IVI) das espécies de plantas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 59,6 ± 12,6, 50,1 ± 6,9, 53,4 ± 6,3, 66,8 ± 10 e 60,1 ± 7,7. Da mesma forma, a frequência de arbustos em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 33,3 ± 4,2, 45 ± 9,4, 46,7 ± 8,2, 55,6 ± 22,2 e 37,5 ± 8,5. Da mesma forma, a frequência de ervas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi: 40,4 ± 6,0, 37,5 ± 5,6, 53,3 ± 7,4, 48,5 ± 5,2 e 46,9 ± 7,4, respectivamente. Nossos resultados mostram a área de estudo como habitat adequado para D. vagabunda.

Sero-epidemiology and risk factor analysis of human brucellosis in Punjab, Pakistan: a cross sectional study

@#Human brucellosis is a neglected zoonotic problem worldwide with a high degree of morbidity in humans and is mostly overlooked due to other febrile conditions. The aim of this study was to evaluate the sero-prevalence and risk factors of human brucellosis among subjects living in Punjab, Pakistan. In this cross-sectional study, human blood samples were collected from seven districts of Punjab, Pakistan. Information regarding personal data, demographic data and potential risk factors was collected through a structured questionnaire. Detection of anti-Brucella antibodies was done through Rose Bengal Plate Test (RBPT) and Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA). Descriptive analysis, Chi square test and Odds ratio was applied using STATA software version 12. The sero-prevalence of human brucellosis was 13.13% with significantly higher percentage in males 17.23% and age group 25-40 years 16.50% (P=< 0.001). The demographic factors positively associated with human brucellosis were lack of education (P = 0.003; OR = 1.85) and farming as an occupation (P =<0.001; OR = 2.50) Similarly, among the risk factors studied, keeping animals at home (P =<0.001; OR = 2.03), slaughtering of animals (P =<0.001; OR = 15.87) and consuming raw milk (P =<0.001; OR = 5.42) were the factors strongly connected with human brucellosis. A massive awareness should be given to livestock farmers and individuals directly linked to animals regarding risk factors and transmission of brucellosis. Consumption of unpasteurized milk and its products should be condemned to curtail this neglected disease.

Tobacco use among school personnel in Rajasthan, India.

BACKGROUND: A very little information about tobacco use among school personnel is available. This is a step to have cross country and within country data using standardized methodology. AIMS: To obtain baseline information about tobacco use prevalence, knowledge and attitude among school personnel. STUDY DESIGN: Two stage cluster sample. SETTING: A state of Rajasthan. MATERIALS AND MATERIALS AND METHODS: A cross-sectional study, using anonymous self-administered questionnaire. A sample of schools with probability proportional to the enrollment in grades 8-10. All school personnel in sampled schools were eligible to participate. STATISTICAL ANALYSIS: Percentage, 95% confidence interval. RESULTS: School response rate was 97.4% (75/77) and school personnel response rate was 67.2% (909/1352). Majority of school personnel (men 69%, women 31%) were school teachers (78.3%). The prevalence of ever any tobacco use was reported by 35.9%, more among men than women (46.2% vs. 13.0%). The prevalence of current daily smoking was reported by 14.4% (men 20.6%, women 0.8%) and occasional by 7.3%, where as current daily smokeless tobacco use was 11.7% (men 16.4%, women 1.1%) and occasional 13.6%. Current daily tobacco use was significantly more among men than women. Four out of nine reported their schools have a tobacco prohibiting policy for both students (48.4%) as well as for school personnel (44.4%) and about same (47.2%) reported their schools enforce its tobacco policy or rule. Over 85% of all school personnel strongly support the tobacco control policies and wanted training in tobacco cessation and prevention. CONCLUSION: First study from Rajasthan to report tobacco use among school personnel. School personnel not only strongly support the tobacco control policies but also ready to work for its successful implementation with proper training.

Paraneoplastic limbic encephalitis associated with bronchogenic carcinoma: a case report.

Paraneoplastic limbic encephalitis is a rare clinical entity, associated most often with the oat cell carcinoma of the lung. Clinically, it presents with affective changes in personality, memory loss, confusional state, hallucinations, and seizures; with dementia being the common feature as the disorder progresses. Response to treatment is disappointingly poor.

Hormones in premenstrual syndrome

Twenty patients with Premenstrual Syndrome [PMS] and eighteen control subjects were studied to determine whether estrogen, progesterone, or prolactin hormone levels are associated with PMS. Blood samples were collected 7-10 days before the menstrual cycle. There was no significant differences between the two groups [P>0.1] indicating the endocrine effect during the luteal phase which do not directly generate the symptoms of PMS